Existen varias limitaciones que deben considerarse para su aplicación: el tipo de plantas utilizado determina la profundidad a tratar; (ii) altas concentraciones de contaminantes pueden resultar tóxicas; (iii) puede depender de la estación del año; (iv) no es efectiva para tratar contaminantes fuertemente sorbidos; (v) la Toxicidad y biodisponibilidad de los productos de la degradación no siempre se conocen y pueden movilizarse o bioacumularse en animales.
Costos y tiempos de remediación Se estima que la fitorremediación de un suelo contaminado con Pb (50 cm de profundidad).
El tiempo estimado de recuperación como primer informe es de un año, donde se estima tener un 30 a 40 % de recuperación del suelo el año se será en tres tandas de 3 meses para siembra y un mes de recopilación de datos, esperando así poder obtener un segundo año de resultados y total recuperación del medio ambiente del sector.